A tanácsnak az MTA szabályzata alapján automatikusan tagja a Magyar Tudományos Akadémia (MTA) ukrajnai külső tagjai, akik mellé 15 tagú tanácsot választott meg a KMAT alakuló közgyűlése 2015. október 30-án.
Az Elnökségben az előre meghatározott kvótáknak megfelelően 7 tudós képviseli a bölcsészet- és társadalomtudományokat, 4 a természettudományokat, 3 pedig az élettudományokat.
A KMAT 2019-ben megválasztott elnöksége
Elnök: Csernicskó István
Alelnök: Spenik Sándor
Az MTA külső tagjaként, választás nélkül elnökségi tag:
Jenkovszky László
Választott elnökségi tagok:
A bölcsészet- és társadalomtudományok képviseletében:
Brenzovics László
Csatáry György
Kopriva Attila
Lizanec Péter
Orosz Ildikó
Zékány Krisztina
Zubánics László
A természettudományok képviseletében:
Fodor Gyula
Gecse Ferenc
Mikla Viktor
Rácz Béla
Az élettudományok képviseletében:
Boldizsár Sándor
Riskó Sándor
Kohut Erzsébet.
Az alakuló ülés során 2015-ben a KMAT a következő elnökséget választotta meg
Az MTA ukrajnai külső tagjai:
- Jenkovszky László
- Szikura József
- Spenik Ottó
A 15 tagú tanácsot választott a testület:
- bölcsészet- és társadalomtudományok:
Brenzovics László
Csatáry György
Csernicskó István
Kopriva Attila
Lizanec Péter
Orosz Ildikó
Zékány Krisztina - természettudományok:Fodor Gyula
Gecse Ferenc
Mica Volodimir
Rácz Béla
Spenik Sándor - élettudományok:Boldizsár SándorKohut Erzsébet
Risko Sándor
Szikura József 2015. december 11-én bekövetkezett halála után a KMAT Elnöksége az alábbi tagokból áll:
Spenik Ottó, elnök
Csernicskó István, alelnök
Az MTA ukrajnai külső tagjaként:
Jenkovszky László
- bölcsészet- és társadalomtudományok képviselői:Brenzovics László
Csatáry György
Kopriva Attila
Lizanec Péter
Orosz Ildikó
Zékány Krisztina - a természettudományok képviselői:Fodor Gyula
Gecse Ferenc
Mica Volodimir
Rácz Béla
Spenik Sándor - az élettudományok képviselői:Boldizsár Sándor
Kohut Erzsébet
Risko Sándor
A KMAT titkári teendőit Dolinai Zsuzsanna látja el.